Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC4A6NH21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC4A6NH21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC4A6NH21 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC4A6NH21 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms