Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEMP2A6NFY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMP2A6NFY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMP2A6NFY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms