Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TCAF2A6NFQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCAF2A6NFQ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCAF2A6NFQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCAF2A6NFQ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms