Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIPSLA2A3N6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PIPSLA2A3N6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIPSLA2A3N6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms