Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPDC1A2A3K4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPDC1A2A3K4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPDC1A2A3K4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPDC1A2A3K4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms