Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRGMA1A4Y4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRGMA1A4Y4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRGMA1A4Y4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms