Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A0A0U1RRA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A0A0U1RRA0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms