Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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