Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6U6

TRAV8-7, T-cell receptor alpha variable 8-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-7A0A075B6U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV8-7A0A075B6U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV8-7A0A075B6U6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRAV8-7A0A075B6U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRAV8-7A0A075B6U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAV8-7A0A075B6U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TRAV8-7A0A075B6U6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV8-7A0A075B6U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV8-7A0A075B6U6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV8-7A0A075B6U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV8-7A0A075B6U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV8-7A0A075B6U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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