Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NOS1-203ENST00000344089 4340 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GNG2-201ENST00000335281 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCDC113-201ENST00000219299 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RHOBTB2-205ENST00000519685 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRIA1-202ENST00000340592 3170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL356599.1-205ENST00000606388 3961 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITGA6-206ENST00000442250 3393 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RASGRP3-201ENST00000402538 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MARCH1-214ENST00000514618 3903 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 XCR1-201ENST00000309285 5281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC003958.2-202ENST00000432258 3890 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms