Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.7 ms