Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG5Q9UPR3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG5Q9UPR3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms