Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPCN1Q9ULQ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms