Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms