Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms