Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APEX2Q9UBZ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms