Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms