Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS1Q9NYS0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms