Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms