Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RASSF4-211ENST00000489171 4350 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.736e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 RASSF4-202ENST00000427758 528 ntTSL 315.48■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 RASSF4-209ENST00000483709 734 ntTSL 514.91□□□□□ -0.026e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 RASSF4-203ENST00000428466 435 ntTSL 313.53□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 RASSF4-204ENST00000462822 354 ntTSL 39.05□□□□□ -0.966e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-225ENST00000464894 754 ntTSL 519.2■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-217ENST00000460051 630 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-226ENST00000465927 893 ntTSL 316.55■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-255ENST00000490622 1579 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-264ENST00000597212 638 ntTSL 315.21■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-262ENST00000593342 271 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.82□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-224ENST00000464709 822 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-247ENST00000483855 606 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-259ENST00000498211 666 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-258ENST00000493979 648 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-228ENST00000467532 877 ntTSL 313.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-251ENST00000488542 1074 ntTSL 313.55□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-220ENST00000462126 622 ntTSL 313.55□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-210ENST00000434389 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-222ENST00000462721 970 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-252ENST00000488762 691 ntTSL 311.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-257ENST00000493517 505 ntTSL 511.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-237ENST00000472252 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-266ENST00000601650 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-218ENST00000460327 762 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-205ENST00000414866 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-223ENST00000463292 642 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 25.45□□□□□ -1.544e-19■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-261ENST00000498593 609 ntTSL 218.75■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-235ENST00000471786 751 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 PPP2R3B-209ENST00000484364 732 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-249ENST00000486450 583 ntTSL 315.83■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 PPP2R3B-204ENST00000468169 713 ntTSL 313.82□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-246ENST00000482321 866 ntTSL 213.63□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-227ENST00000466587 325 ntTSL 511.68□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-242ENST00000476246 712 ntTSL 311.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-267ENST00000602679 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.56□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 DMKN-234ENST00000471017 410 ntTSL 28.56□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ERBB3-208ENST00000549205 971 ntTSL 512.45□□□□□ -0.422e-10■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-10■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ERBB3-211ENST00000549644 306 ntTSL 38.74□□□□□ -1.012e-10■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 212.41□□□□□ -0.426e-18■■■■□ 24.2
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RBM22Q9NW64 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-9■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-9■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-9■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-13■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.345e-13■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-13■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.584e-9■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.625e-13■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 210.77□□□□□ -0.694e-9■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.383e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.43e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 VPS13D-202ENST00000460333 4910 ntTSL 26.12□□□□□ -1.432e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.442e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.612e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.01□□□□□ -1.934e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 21.71□□□□□ -2.144e-6■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.28□□□□□ -2.25e-7■■■■□ 24.2
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 222.79■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 511.31□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.686e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.26e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.246e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.266e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.396e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.436e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-16■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.736e-16■■■■□ 24.1
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