Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms