Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms