Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MTMR12Q9C0I1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR12Q9C0I1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms