Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LPIN3Q9BQK8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms