Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOPXQ9BPY8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms