Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN18Q96SJ8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms