Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms