Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRF1Q92994 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms