Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms