Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms