Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG9BQ674R7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms