Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms