Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CCDC142Q17RM4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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