Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF13Q15543 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms