Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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