Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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DNASE1L3Q13609 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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DNASE1L3Q13609 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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