Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRJQ12913 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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