Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms