Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms