Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms