Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms