Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms