Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms