Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms