Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms