Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXYD4P59646 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms