Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRISP1P54107 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms