Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IST1P53990 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IST1P53990 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IST1P53990 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IST1P53990 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IST1P53990 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IST1P53990 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms