Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RND2P52198 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RND2P52198 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RND2P52198 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND2P52198 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms