Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms